目錄
第1章緒論1
1.1引言1
1.2全比較問題及全比對數(shù)據(jù)分發(fā)問題的形式化描述3
1.3全比較問題研究動態(tài)6
1.4基因組序列比對大數(shù)據(jù)分發(fā)模型研究現(xiàn)狀10
1.5大數(shù)據(jù)計算技術(shù)13
1.6本章小結(jié)21
參考文獻22
第2章基于整數(shù)規(guī)劃的基因組序列比對大數(shù)據(jù)分發(fā)模型30
2.1文件分發(fā)模型的構(gòu)建30
2.2文件分發(fā)算法設(shè)計33
2.3實驗設(shè)計與結(jié)果分析36
2.4模型優(yōu)化與改進 41
2.5全量分發(fā)、Hadoop分發(fā)和文件分發(fā)模型比較實驗 54
2.6本章小結(jié) 61
參考文獻61
第3章基于啟發(fā)式的基因組序列比對大數(shù)據(jù)分發(fā)模型63
3.1文件分發(fā)模型的構(gòu)建63
3.2文件分發(fā)算法設(shè)計71
3.3實驗設(shè)計與實驗結(jié)果分析80
3.4模型優(yōu)化與改進88
3.5本章小結(jié)98
參考文獻98
第4章基于粒子群優(yōu)化的全比較計算數(shù)據(jù)分發(fā)策略101
4.1引言101
4.2全比較計算相關(guān)研究102
4.3DDBPSO模型相關(guān)算法設(shè)計107
4.4相關(guān)實驗與結(jié)果分析115
4.5本章小結(jié)125
參考文獻125
第5章文件切分方案評價模型研究與構(gòu)建128
5.1文件切分方案評價指標體系的建立 128
5.2利用層次分析法建立文件切分模型 130
5.3文件切分最優(yōu)個數(shù)的確定 135
5.4文件切分算法設(shè)計 138
5.5文件合并算法 141
5.6本章小結(jié) 143
參考文獻144
第6章面向全比較問題的分布式文件分發(fā)框架構(gòu)建145
6.1分布式文件分發(fā)框架結(jié)構(gòu)設(shè)計145
6.2文件分發(fā)策略計算 146
6.3文件傳輸 149
6.4系統(tǒng)實現(xiàn) 150
6.5相關(guān)實驗 153
6.6本章小結(jié)168
參考文獻 168