目錄
前言
第1章　緒論　1
1.1　我國主要天然香料植物　1
1.1.1　我國天然香料植物分布　2
1.1.2　我國天然香料植物分類　2
1.1.3　天然香料植物的利用價值　3
1.2　樟科芳香植物資源　4
1.2.1　樟科簡介　4
1.2.2　樟科植物的用途　5
1.2.3　樟科芳香資源簡介　5
1.2.4　樟科芳香植物資源育種、栽培研究　6
參考文獻　7
第2章　樟科木姜子屬芳香植物資源　8
2.1　木姜子屬芳香植物資源概述　8
2.1.1　樟科木姜子屬植物形態(tài)及系統(tǒng)學(xué)研究概況　8
2.1.2　木姜子屬植物分子系統(tǒng)學(xué)　9
2.1.3　木姜子屬落葉組植物的功能及應(yīng)用　9
2.1.4　木姜子屬落葉組植物揮發(fā)性芳香精油化學(xué)成分　10
2.2　木姜子屬落葉組植物形態(tài)鑒定　11
2.3　木姜子屬芳香植物類群系統(tǒng)生物學(xué)分類　19
2.3.1　測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估　21
2.3.2　測序結(jié)果與參考基因組比對分析　22
2.3.3　木姜子屬落葉組植物系統(tǒng)發(fā)育分析　23
2.4　木姜子屬落葉組植物化學(xué)成分分析　26
2.4.1　木姜子屬落葉組植物葉片化學(xué)成分檢測與鑒定　27
2.4.2　木姜子屬落葉組植物葉片揮發(fā)油化學(xué)指紋分析　44
2.4.3　三種木姜子屬植物精油化學(xué)成分分析　45
參考文獻　49
第3章　山蒼子遺傳多樣性研究及種質(zhì)資源收集　51
3.1　山蒼子簡介　51
3.1.1　山蒼子生物學(xué)特性　51
3.1.2　山蒼子的分布　52
3.1.3　山蒼子的用途　52
3.2　山蒼子天然居群葉片和種實性狀表型多樣性　55
3.2.1　山蒼子天然居群間和居群內(nèi)葉片及種實性狀的形態(tài)學(xué)特征　55
3.2.2　山蒼子居群內(nèi)葉片性狀和種實性狀的變異分析　57
3.2.3　山蒼子居群間葉片性狀和種實性狀的表型分化　58
3.2.4　山蒼子葉片和種實表型性狀與采樣點地理氣候因子的相關(guān)性分析　58
3.2.5　不同地理居群山蒼子葉片和種實表型性狀的聚類分析　59
3.3　山蒼子天然群體果實含油率和檸檬醛含量差異的研究　61
3.3.1　山蒼子不同群體含油率和檸檬醛含量分析　61
3.3.2　山蒼子果實含油率和檸檬醛含量與原產(chǎn)地地理生態(tài)因子的相關(guān)性分析　62
3.3.3　山蒼子含油率和檸檬醛含量的系統(tǒng)聚類分析　63
3.4　山蒼子天然群體精油成分分析　64
3.5　山蒼子種質(zhì)資源收集　67
參考文獻　68
第4章　山蒼子精油抑菌活性　69
4.1　山蒼子精油抑菌活性評價　69
4.1.1　山蒼子精油抑制細菌活性　69
4.1.2　山蒼子精油抑制真菌活性　71
4.2　幾種山蒼子精油抑菌活性評價　72
4.3　山蒼子精油主要成分與抑菌效果相關(guān)性分析　74
參考文獻　75
第5章　山蒼子遺傳育種研究　76
5.1　山蒼子家系物候期觀察　76
5.1.1　山蒼子家系萌芽和展葉物候期觀察　76
5.1.2　山蒼子家系開花物候期觀察　79
5.1.3　山蒼子家系結(jié)實物候期觀察　82
5.2　山蒼子家系苗期生長性狀遺傳變異分析　84
5.2.1　山蒼子苗高和地徑生長節(jié)律　84
5.2.2　山蒼子苗期生長性狀遺傳變異分析　85
5.2.3　山蒼子苗期生長性狀聚類分析　85
5.3　山蒼子幼林期生長性狀遺傳變異分析　86
5.3.1　生長性狀方差分析　86
5.3.2　生長性狀變異參數(shù)估算　87
5.3.3　AMMI模型和線性回歸模型比較　88
5.3.4　試驗點鑒別力分析　89
5.4　山蒼子不同家系果實產(chǎn)量和含油率遺傳變異分析　89
5.4.1　山蒼子林分和環(huán)境因子與其經(jīng)濟指標的關(guān)聯(lián)特征　89
5.4.2　山蒼子經(jīng)濟性狀多重比較　92
5.4.3　生長性狀和經(jīng)濟性狀相關(guān)性分析　93
5.4.4　優(yōu)良家系選　94
參考文獻　96
第6章　山蒼子育苗技術(shù)　97
6.1　實生苗培育技術(shù)　97
6.1.1　種子準備　97
6.1.2　育苗　97
6.1.3　質(zhì)量分級　98
6.1.4　苗木出圃　99
6.2　采穗賄建技術(shù)　99
6.2.1　采穗圃營建分類　99
6.2.2　圃地選擇與規(guī)劃　99
6.2.3　品種選擇　99
6.2.4　采穗圃營建　99
6.2.5　經(jīng)營管理技術(shù)　100
6.3　嫁接技術(shù)　100
6.3.1　砧木選擇　100
6.3.2　接穗采集　101
6.3.3　接穗貯藏　101
6.3.4　嫁接時間和方法　101
6.3.5　嫁接苗管理　101
6.4　扦插技術(shù)　101
6.4.1　苗床準備　101
6.4.2　插穗的選　102
6.4.3　介質(zhì)材料　102
6.4.4　生根處理　102
6.4.5　扦插方式　102
6.4.6　扦插后管理　102
參考文獻　102
第7章　山蒼子栽培技術(shù)　103
7.1　山蒼子立地類型劃分　103
7.1.1　影響山蒼子生長的立地主導(dǎo)因子　103
7.1.2　立地類型劃分　105
7.2　山蒼子立地質(zhì)量評價　107
7.2.1　山蒼子立地質(zhì)量評價指標選擇　107
7.2.2　基于數(shù)量理論山蒼子立地質(zhì)量評價　107
7.2.3　基于土壤理化性質(zhì)山蒼子立地質(zhì)量評價　113
7.3　山蒼子造林技術(shù)　116
7.3.1　造林技術(shù)　116
7.3.2　撫育管理　117
7.3.3　更新復(fù)壯　117
7.3.4　果實采收　118
7.4　主要病蟲害防治　118
參考文獻　118
第8章　山蒼子基因組圖譜構(gòu)建及進化　120
8.1　基因組圖譜　120
8.1.1　樟科植物基因組研究概況　120
8.1.2　山蒼子基因組的測序和組裝　121
8.1.3　基因組注　123
8.2　山蒼子進化　125
8.2.1　基因家族進化分析　125
8.2.2　木蘭類單子葉植物和雙子葉植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系　127
8.2.3　全基因組復(fù)制事件分析　129
8.2.4　山蒼子基因組為揭示樟科起源和遺傳改良提供了新視角　130
參考文獻　132
第9章　山蒼子花發(fā)育機制　134
9.1　山蒼子花發(fā)育的形態(tài)特征　134
9.1.1　山蒼子花芽分化　134
9.1.2　山蒼子花器官形態(tài)發(fā)育　136
9.1.3　山蒼子小孢子發(fā)生和雄配子體發(fā)育　136
9.1.4　山蒼子大孢子發(fā)生和雌配子體發(fā)育　139
9.2　山蒼子花發(fā)育的生理特性　140
9.2.1　花發(fā)育相關(guān)的生理因子　140
9.2.2　山蒼子花發(fā)育的生理特征　143
9.3　山蒼子花發(fā)育的分子基礎(chǔ)　155
9.3.1　山蒼子花芽不同分化時期差異表達基因的功能分析　156
9.3.2　山蒼子花芽不同分化時期差異表達基因分析　158
9.3.3　山蒼子花芽不同分化時期差異表達基因的GO富集分析　159
參考文獻　160
第10章　山蒼子性別分化機制　162
10.1　山蒼子性別分化的形態(tài)特征　162
10.1.1　山蒼子雌、雄花形態(tài)結(jié)構(gòu)　162
10.1.2　山蒼子雌、雄花中退化器官形態(tài)結(jié)構(gòu)特征　163
10.2　水分及氮素利用效率性別特異性動態(tài)　164
10.2.1　山蒼子雌、雄植株葉片^13C值和d15N值比較　164
10.2.2　山蒼子雌、雄植株葉片碳含量、氮含量及碳氮比比較　165
10.2.3　山蒼子雌、雄植株葉片J13C與氮含量相關(guān)性分析　165
10.2.4　山蒼子雌、雄植株葉片水分利用效率與氮素利用效率相關(guān)性分析　165
10.3　激素水平性別特異性規(guī)律　167
10.3.1　山蒼子花退化過程中1-氨基環(huán)丙烷羧酸、茉莉酸甲酯和水楊酸甲酯的變化規(guī)律　168
10.3.2　山蒼子花退化過程中吲咮乙酸、茉莉酸、水楊酸、赤霉素和反式玉米素核苷檢測　170
10.4　山蒼子雌花中退化雄蕊發(fā)育過程中基因表達規(guī)律及相關(guān)基因挖掘　173
10.4.1　轉(zhuǎn)錄組測序組裝結(jié)果分析　173
10.4.2　基因功能的注釋和分類　174
10.4.3　差異表達基因的鑒定與富集分析　175
10.4.4　山蒼子退化雄蕊發(fā)育候選基因篩選　177
10.4.5　山蒼子水楊酸合成信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑基因篩選　177
10.4.6　山蒼子SA途徑中LcTGA9和LcTGAW表達模式　180
10.5　樟科植物的性別差異基因篩選　182
10.5.1　樟科物種花的結(jié)構(gòu)特征　184
10.5.2　TGA9和TGA10同源基因表達分析　184
10.6　LcTGA10基因抑制雄蕊的發(fā)育形成　187
10.6.1　山蒼子LcTGA9和LcTGA10基因同源比較分析和預(yù)測　187
10.6.2　山蒼子LcTGA10亞細胞定位　188
10.6.3　擬南芥tga9和tga10突變體鑒定和表型觀測　189
10.6.4　LcTGA9和LcTGA10過表達擬南芥鑒定和表型　190
10.6.5　擬南芥SA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)關(guān)鍵基因定量結(jié)果分析　194
10.7　山蒼子性別鑒定的分子標記　195
10.7.1　山蒼子性別相關(guān)的SRAP標記　195
10.7.2　山蒼子性別相關(guān)的SCAR標記　196
參考文獻　199
第11章　山蒼子精油合成分子機制　200
11.1　山蒼子果實發(fā)育過程　200
11.2　山蒼子果皮發(fā)育過程中精油含量變化　201
11.3　山蒼子精油生物合成通路　202
11.3.1　MVA和MEP途徑基因的全基因組鑒定　203
11.3.2　山蒼子IPS基因家族鑒定和進化分析　204
11.3.3　山蒼子TPS基因家族鑒定和進化分析　206
11.3.4　山蒼子萜類合成途徑　209
11.3.5　萜類合成途徑基因的染色體分布和基因簇分析　209
11.4　山蒼子精油生物合成相關(guān)酶和基因　211
11.4.1　羥甲基戌二酰CoA合酶　211
11.4.2　香葉基焦磷酸合酶小亞基LcuGPPS.SSUl　221
11.4.3　單萜合酶 LcuTPS　226
參考文獻　230
第12章　山蒼子再生體系和遺傳轉(zhuǎn)化體系　233
12.1　山蒼子再生體系建立　233
12.1.1　不同外植體愈傷組織的誘導(dǎo)　233
12.1.2　愈傷組織不定芽的誘導(dǎo)　234
12.1.3　不定芽生根培養(yǎng)　236
12.1.4　不定芽再生的組織學(xué)觀察　236
12.2　山蒼子再生體系的優(yōu)化　238
12.2.1　培養(yǎng)基的配制及實驗方法　238
12.2.2　山蒼子再生體系中外源激素的優(yōu)化　239
12.3　山蒼子遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立及優(yōu)化　242
12.3.1　培養(yǎng)基的配制及實驗方法　242
12.3.2　潮霉素對愈傷組織誘導(dǎo)、生長及分化的影響　243
12.3.3　頭孢霉素對愈傷組織生長的影響　244
12.3.4　農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化步驟　244
12.4　山蒼子原生質(zhì)體瞬時轉(zhuǎn)化