李應(yīng)祥，湖廣九溪衛(wèi)人。憑借武生身份隨軍作戰(zhàn)，累積戰(zhàn)功做到廣西思恩參將。
萬(wàn)歷七年(1579)，巡撫張任征伐十座敵營(yíng)，其中有李應(yīng)祥的一份功勞。就在原地設(shè)置三個(gè)鎮(zhèn)，修筑城池駐兵防守，李應(yīng)祥正負(fù)責(zé)營(yíng)建事務(wù)，正好提拔為松潘副總兵，主持修城的官員上疏挽留他，以新官階上舊任。跟著總兵王尚文大敗馬平匪徒韋王明。不久代理都督僉事，進(jìn)入朝廷擔(dān)任五軍營(yíng)副將。
萬(wàn)歷十三年(1585)改任南京左府僉事，出任四川總兵官。松潘、茂州各少數(shù)民族建立四十八座山寨，每年都是當(dāng)?shù)毓倜竦囊淮蟮満?。王廷瞻巡撫四川時(shí)，曾派副將吳子忠擊破丟骨、人荒、沒(méi)舌三座山寨，各土著首領(lǐng)于是投降。按過(guò)去慣例，各土著每年都有賞賜，土著依靠武力要挾勒索沒(méi)有止境。進(jìn)入寨堡的，要交納下馬錢、上馬錢、解渴錢、過(guò)堡酒錢和熱衣氣力偏手錢；駐軍輪換駐防，也要交錢，叫作新班錢、架梁錢、放狗錢、踩草錢、掛彩錢。王廷瞻將它們?nèi)繌U除，西部邊疆才稍稍平定。僅僅過(guò)了六七年，土著勢(shì)力又重新猖獗起來(lái)。這一年夏天，楊柳土著出擊普安堡，侵犯歸水崖、石門(mén)坎，于是進(jìn)入金瓶堡，殺死守堡將領(lǐng)。巡撫雒遵交給李應(yīng)祥征討他們。李應(yīng)祥帶領(lǐng)三千士兵進(jìn)入茂州，攻克一座山巖。土著依靠險(xiǎn)要地形，照樣搶劫。
不久，雒遵罷官，徐元泰代替他。傳布檄文告知，使者來(lái)回有三次，土著不答理。土著窺探蒲江關(guān)，阻斷歸水崖、黃土坎的道路，在五哨構(gòu)筑城墻，斷絕東南方的聲援?？吹秸Ρ∪?，互相笑著說(shuō)：“這般磨子兵，能把我們?cè)鯓樱 彼^磨子，意思是說(shuō)多次旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)但數(shù)量不增加。這年冬天，土著突襲平夷堡，搶劫平民百姓，剖開(kāi)他們的肚子，將腸子繞在二個(gè)牛角上，牛一跪，腸子就一寸一寸地?cái)嗔?。第二年正月，包圍蒲江關(guān)，用土炮摧毀城墻。守將朱文達(dá)出城迎戰(zhàn)，殺死幾十人。匪徒慢慢離去，通往東南方的道路才開(kāi)始打通。
徐文泰決定大規(guī)模征討。各路兵力全部匯合后，命令游擊周于德統(tǒng)帥播州兵充當(dāng)前鋒，游擊邊之垣統(tǒng)帥酉陽(yáng)兵作為后衛(wèi)，原總兵郭成統(tǒng)帥敘、馬兵扼守要害地帶，參將朱文達(dá)統(tǒng)帥平茶兵攻擊兩側(cè)，而讓李應(yīng)祥在中間協(xié)調(diào)作戰(zhàn)，參將王鳳監(jiān)軍。李應(yīng)祥下令在宮中樹(shù)立紅旗、白旗各一面。陷入匪徒陣中的平民百姓只要空手站在紅旗下面，不依附于匪徒的土著只要空手站在白旗下面，就可以免除罪責(zé)。土著人雖多，到了危急的時(shí)候卻不能互相營(yíng)救。有位國(guó)師喇嘛，很狡猾，跟青海土著首領(lǐng)丙兔、灣仲、占柯等人結(jié)成親家，將大小各姓連在一起刻在木板上，歃血為盟。到這時(shí)，邀請(qǐng)灣仲、占柯先侵犯歸化攻打政府軍。周于德用計(jì)謀抓獲喇嘛、灣仲，守備曹希彬又殺死占柯。丟骨、人荒、沒(méi)舌三座寨堡最頑強(qiáng)，周于德將它們都攻克了，又接連擊破卜洞王等寨堡，朱文達(dá)、郭成、邊之垣也各自攻破幾座寨堡，跟周于德的部隊(duì)匯合，于是占領(lǐng)蜈蚣、茹兒等敵軍巢穴。嘉靖初年，邊之垣的祖父邊輪當(dāng)指揮時(shí)討伐茹兒的強(qiáng)盜，被強(qiáng)盜殺害，強(qiáng)盜把邊輪的頭骨上漆當(dāng)作喝水飲酒的工具。到這時(shí)已有六十年，邊之垣才得到它，把它拿回去埋葬了。
匪徒屢次失敗，處境困難，全都拋棄輜重引誘政府軍。政府軍不上當(dāng)，殺敵入關(guān)，匪徒多戰(zhàn)死。河?xùn)|平定，不久渡河向西進(jìn)軍，接連攻克西坡、西革、歪地、乾溝、樹(shù)底各敵據(jù)點(diǎn)。有一個(gè)名叫小粟谷的，首先叛亂。偵察大部隊(duì)西行，不做防備。郭成在晚上偷襲它，大獲全勝。牛尾砦形勢(shì)尤其險(xiǎn)惡，官兵分三路夾攻，放火燒毀柵欄，殺死敵匪頭子合兒結(jié)父子，河西也平定了。各部軍隊(duì)繳獲匪徒搜集的糧食，停留了十天，將所有的寨堡都放火燒了，在六月份凱旋回師。那些逃入深山老林的，請(qǐng)求偏頭結(jié)賽投降，李應(yīng)祥命令他們埋奴發(fā)誓，然后同意了。所謂“埋奴”，是指當(dāng)?shù)赝林祷亟觼?lái)奴隸，把他們送到軍隊(duì)前面，指天發(fā)誓，立即把他們牽到大路上，挖坑埋葬，將頭留在外面，一共埋了二十三個(gè)人。偏頭結(jié)賽一向跟天竺僧人很好。僧人說(shuō)雞狗之年，土著有災(zāi)難，偏頭結(jié)賽相信他的話，預(yù)先躲到深山里去。逃亡的匪徒把他當(dāng)作神一樣，跟著他，請(qǐng)求他收容，所以偏頭結(jié)賽請(qǐng)求投降。這一仗，焚毀碉堡一千六百多座，活捉匪徒頭目三十多人，俘虜數(shù)以千計(jì)。從此之后，各土著少數(shù)民族受到極大的震動(dòng)，不敢再為非作歹，邊疆人民樹(shù)立石碑記載了這次功績(jī)。
建昌、越..各衛(wèi)所，各少數(shù)民族與漢人雜居。建昌叛匪頭目有安寧、五咱、王大咱等人，跟越..邛部黑骨夷一起發(fā)作叛亂。巡撫徐元泰準(zhǔn)備討伐，征兵一萬(wàn)八千人。仍然讓朱文達(dá)、邊之垣分別帶領(lǐng)，由李應(yīng)祥統(tǒng)帥，副使周光鎬監(jiān)督。十一月，周光鎬先渡過(guò)瀘江，黑骨夷和王大咱已經(jīng)占據(jù)相嶺，焚燒了三峽橋，五咱等人也侵犯禮州、德昌二所。這時(shí)征兵還沒(méi)有集中，周光鎬先布置疑陣，來(lái)試探相嶺的匪徒，匪徒果然退到桐槽據(jù)守。桐槽是王大咱的大本營(yíng)。不久各路兵都抵達(dá)越..。李應(yīng)祥命令朱文達(dá)攻擊五咱，邊之垣攻擊王大咱，暫且將黑骨夷放到一邊不做處理。半夜疾行軍三百里直達(dá)禮州。匪徒渡河渡到一半，朱文達(dá)打敗了他們，于是渡過(guò)河直搗敵人的老巢。邊之垣也多次攻陷桐槽，王大咱逃入山谷中。
不久，五咱占領(lǐng)磨旗山向政府軍挑戰(zhàn)。政府軍從兩邊夾擊，匪徒撤退到毛牛山設(shè)防。毛牛山延綿廣大六七百里，連接很多土著部落，朱文達(dá)部大敗毛牛山匪徒，五咱向西逃跑，跟安守匯合，在西溪構(gòu)筑防御工事。正好征集的三千鹽井馬剌兵趕到，面目猙獰，跳躍前進(jìn)，形象不同于一般人，各土著非常害怕他們。李應(yīng)祥偵探到匪徒將要來(lái)劫營(yíng)，于是悄悄地將自己的軍營(yíng)遷走，而讓馬剌兵駐扎在自己兵營(yíng)的原處。到了晚上匪徒來(lái)偷襲。馬剌兵奮起還擊，匪徒死傷遍地。各將領(lǐng)于是進(jìn)攻西溪，北面到達(dá)磨砦七板番。各路兵匯合在一起準(zhǔn)備攻打五咱，而命令副將田中科在麥達(dá)扎營(yíng)，威脅安守。正好有間諜報(bào)告安守計(jì)劃襲擊田中科，李應(yīng)祥跟材官高逢勝喝了三大杯酒，命令他率領(lǐng)三百人的敢死隊(duì)疾行軍七十里，抵達(dá)麥達(dá)設(shè)下埋伏，安守晚上到來(lái)，遇埋伏被活捉了。安守是眾匪徒的首領(lǐng)，安守死，西南邛笮、苴蘭、靡莫各土著首領(lǐng)都感到震動(dòng)害怕。商山四堡的土著向邊之垣乞求投降，大小七板番向朱文達(dá)乞求投降。各自在路旁埋奴，呼號(hào)叩頭，發(fā)誓世世代代不敢叛亂。五咱勢(shì)單力薄，逃往昌州，也被副將王言抓獲了。
土木安四兒，居住在連昌城中，偷偷地到城外搶劫騷擾，到這時(shí)得知災(zāi)禍要降臨了。率領(lǐng)黨徒幾百人逃到虛郎溝，把那里作為據(jù)點(diǎn)。各軍消滅五咱后，李應(yīng)祥把軍隊(duì)派往北邊，裝出將要討伐黑骨夷的樣子，安四兒于是放松了警惕。李應(yīng)祥忽然揮軍回頭襲擊他，抓獲了安四兒。
又討伐王大咱。當(dāng)初，王大咱失敗，躲藏到他的朋友普雄土著首領(lǐng)姑咱的住處，李應(yīng)祥大軍到來(lái)，姑咱害怕了，秘密告訴了副將王之翰，王之翰搜查到了王大咱，而黑夷的土著首領(lǐng)阿弓等七個(gè)人住在大孤山，在此之前也被王之翰抓獲了。到這時(shí)建昌、越..各土著都平定了。獻(xiàn)首級(jí)二千多兵，招降三千多人。這時(shí)是萬(wàn)歷十五年(1587)七月。
土著部落膩乃屬于邛部，鄰近馬湖。它的首領(lǐng)撒假跟他的表兄安興、木瓜部落的白祿、雷坡的強(qiáng)盜楊九乍等人，多次侵犯搶劫內(nèi)地。巡撫曾省吾準(zhǔn)備討伐他們。正好都蠻戰(zhàn)役，沒(méi)有實(shí)行。于是修建六座碉堡，增加防守兵力一千二百人，而各土著仍像過(guò)去一樣猖狂。等到建昌、越..打仗時(shí)，各土著又窩藏叛匪。徐元泰于是命令都指揮李獻(xiàn)忠等人分兵圍剿。匪徒假裝投降，誘惑抓住李獻(xiàn)忠等三位將領(lǐng)，殺死士兵數(shù)千人，勢(shì)力更加猖獗。李應(yīng)祥等人回師凱旋，徐元泰更加征發(fā)播州、酉陽(yáng)等地的土著兵，一共五萬(wàn)人，命令李應(yīng)祥統(tǒng)帥朱文達(dá)、邊之垣和周于德各將領(lǐng)分三路進(jìn)入，原總兵郭成也隨軍出征。十月，周于德首先打敗白祿兵，追到馬蝗山，攀登索梯上山，匪徒潰敗。乘勝攻擊木瓜部，射死白祿。追趕到利濟(jì)山，雪有幾尺深。周于德首先登山，再次大敗匪徒，放火焚燒了敵據(jù)點(diǎn)。當(dāng)初，撒假跟陳九乍率領(lǐng)一萬(wàn)人占據(jù)山頭，播州兵把他們打跑了。到這時(shí)，朱文達(dá)又一次在大田壩打敗他們，匯合周于德部追擊，所到之處都取得勝利。游擊萬(wàn)鏊在鼠囤偷襲撒假，抓獲了他的妻子、兒子。郭成又在三寶山跟撒假大戰(zhàn)，活捉了他。安興據(jù)守大本營(yíng)，朱文達(dá)、萬(wàn)鏊分兵進(jìn)擊，抓獲了他的母親、妻子。安興在逃跑途中丟一些金子，減緩追趕他的人的速度，于是才得以逃脫。不久，各路大軍深入進(jìn)剿，最終抓獲了他。其他土著部落害怕而投降的有二千多人。全部都交出了田地，愿意向朝廷進(jìn)貢，于是罷兵。一共斬首一千六百九十，俘虜七百三十多人，在這個(gè)地方設(shè)置屏山縣。按軍功，李應(yīng)祥累積加官到都督同知，徐元泰也做到兵部尚書(shū)。
這時(shí)，四川一帶厲害的盜匪都已平定，李應(yīng)祥威名遠(yuǎn)揚(yáng)。御史傅霈巡檢部屬，責(zé)備李應(yīng)祥冒領(lǐng)軍餉。李應(yīng)祥賄賂他八千兩銀子，被他上報(bào)了，罷了李應(yīng)祥的官。兵部推薦李應(yīng)祥做南京右府僉書(shū)，給事中薛三才堅(jiān)持不同意。
萬(wàn)歷二十八年(1600)大規(guī)模征伐播州。貴州總兵官董元鎮(zhèn)停留不前，總督李化龍彈劾他，推薦李應(yīng)祥代替他。這時(shí)軍隊(duì)分為八道，貴州分為烏江、興隆二道。下詔董元鎮(zhèn)充當(dāng)事官由烏江道進(jìn)入，李應(yīng)祥由興隆道進(jìn)入，各道限定在二月十五日進(jìn)兵。李應(yīng)祥還沒(méi)有上任，副將陳寅等人已連克數(shù)座敵營(yíng)，將匪徒趕到四牌高囤下面，另外派小分隊(duì)從小路直搗龍水囤。其他將領(lǐng)蔡兆吉又從乾坪抵達(dá)箐岡，經(jīng)過(guò)四牌。強(qiáng)盜頭子謝朝俸經(jīng)營(yíng)他的根據(jù)地，四面都是叢林峭壁，前面有二道關(guān)隘。強(qiáng)盜們從高處往下吶喊沖擊，政府軍拼死作戰(zhàn)，俘虜了謝朝俸的老婆孩子，乘勝利之勢(shì)進(jìn)抵河畔，正好碰到烏江失敗的書(shū)信到達(dá)，收拾部隊(duì)原地待命有十來(lái)天。等到李應(yīng)祥上任，便催促各將領(lǐng)快速渡河，陳寅等人于是一邊從其他途徑渡河，一邊卻偷偷地架設(shè)浮橋渡過(guò)大部隊(duì)。各軍渡河后，匪徒失去可以憑借的天險(xiǎn)，紛紛乞求投降，李應(yīng)祥全都接受了。匪徒所憑借的只有黃灘關(guān)，它像墻壁一樣陡直，眾匪徒在那里死守。正好匪徒石勝俸等率領(lǐng)一萬(wàn)多人投降，告訴說(shuō)：“離黃灘三十里有三個(gè)關(guān)隘，是進(jìn)入播州的門(mén)戶，先攻取這三關(guān)，那么黃灘就孤立難守了?！崩顟?yīng)祥同意了這個(gè)計(jì)劃，命令陳寅率領(lǐng)精兵四千人在夜晚抵達(dá)關(guān)下。石勝俸帶著幾十個(gè)騎兵引誘匪徒開(kāi)門(mén)，然后殲滅了守門(mén)匪徒。黃灘的匪徒們害怕了。陳寅統(tǒng)領(lǐng)各位將領(lǐng)渡河猛攻關(guān)前，石勝俸從墳林暗渡偷襲關(guān)后，匪徒于是大敗。李應(yīng)祥直達(dá)海龍囤，聯(lián)合各路部隊(duì)一起消滅了楊應(yīng)龍。
播州平定后，回師鎮(zhèn)守銅仁。第二年改派鎮(zhèn)守四川，播州匪徒的余黨吳洪、盧文秀等人討厭有關(guān)部門(mén)法令太嚴(yán)，而遵義知縣蕭鳴世又不得人心。吳洪等人于是宣稱楊應(yīng)龍還有兒子在世，聚集眾人叛亂。李應(yīng)祥隨同副使傅光宅一起搜捕他們，將他們?nèi)孔カ@。李應(yīng)祥不久死于任上。因?yàn)槠蕉úブ萦泄?，?zèng)左都督，世代蔭封為千戶。
李應(yīng)祥作為將領(lǐng)，有勇有謀，所到之處都捷報(bào)頻傳。平定四川三大盜匪，李應(yīng)祥居功最多。
萬(wàn)歷七年(1579)，巡撫張任征伐十座敵營(yíng)，其中有李應(yīng)祥的一份功勞。就在原地設(shè)置三個(gè)鎮(zhèn)，修筑城池駐兵防守，李應(yīng)祥正負(fù)責(zé)營(yíng)建事務(wù)，正好提拔為松潘副總兵，主持修城的官員上疏挽留他，以新官階上舊任。跟著總兵王尚文大敗馬平匪徒韋王明。不久代理都督僉事，進(jìn)入朝廷擔(dān)任五軍營(yíng)副將。
萬(wàn)歷十三年(1585)改任南京左府僉事，出任四川總兵官。松潘、茂州各少數(shù)民族建立四十八座山寨，每年都是當(dāng)?shù)毓倜竦囊淮蟮満?。王廷瞻巡撫四川時(shí)，曾派副將吳子忠擊破丟骨、人荒、沒(méi)舌三座山寨，各土著首領(lǐng)于是投降。按過(guò)去慣例，各土著每年都有賞賜，土著依靠武力要挾勒索沒(méi)有止境。進(jìn)入寨堡的，要交納下馬錢、上馬錢、解渴錢、過(guò)堡酒錢和熱衣氣力偏手錢；駐軍輪換駐防，也要交錢，叫作新班錢、架梁錢、放狗錢、踩草錢、掛彩錢。王廷瞻將它們?nèi)繌U除，西部邊疆才稍稍平定。僅僅過(guò)了六七年，土著勢(shì)力又重新猖獗起來(lái)。這一年夏天，楊柳土著出擊普安堡，侵犯歸水崖、石門(mén)坎，于是進(jìn)入金瓶堡，殺死守堡將領(lǐng)。巡撫雒遵交給李應(yīng)祥征討他們。李應(yīng)祥帶領(lǐng)三千士兵進(jìn)入茂州，攻克一座山巖。土著依靠險(xiǎn)要地形，照樣搶劫。
不久，雒遵罷官，徐元泰代替他。傳布檄文告知，使者來(lái)回有三次，土著不答理。土著窺探蒲江關(guān)，阻斷歸水崖、黃土坎的道路，在五哨構(gòu)筑城墻，斷絕東南方的聲援?？吹秸Ρ∪?，互相笑著說(shuō)：“這般磨子兵，能把我們?cè)鯓樱 彼^磨子，意思是說(shuō)多次旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)但數(shù)量不增加。這年冬天，土著突襲平夷堡，搶劫平民百姓，剖開(kāi)他們的肚子，將腸子繞在二個(gè)牛角上，牛一跪，腸子就一寸一寸地?cái)嗔?。第二年正月，包圍蒲江關(guān)，用土炮摧毀城墻。守將朱文達(dá)出城迎戰(zhàn)，殺死幾十人。匪徒慢慢離去，通往東南方的道路才開(kāi)始打通。
徐文泰決定大規(guī)模征討。各路兵力全部匯合后，命令游擊周于德統(tǒng)帥播州兵充當(dāng)前鋒，游擊邊之垣統(tǒng)帥酉陽(yáng)兵作為后衛(wèi)，原總兵郭成統(tǒng)帥敘、馬兵扼守要害地帶，參將朱文達(dá)統(tǒng)帥平茶兵攻擊兩側(cè)，而讓李應(yīng)祥在中間協(xié)調(diào)作戰(zhàn)，參將王鳳監(jiān)軍。李應(yīng)祥下令在宮中樹(shù)立紅旗、白旗各一面。陷入匪徒陣中的平民百姓只要空手站在紅旗下面，不依附于匪徒的土著只要空手站在白旗下面，就可以免除罪責(zé)。土著人雖多，到了危急的時(shí)候卻不能互相營(yíng)救。有位國(guó)師喇嘛，很狡猾，跟青海土著首領(lǐng)丙兔、灣仲、占柯等人結(jié)成親家，將大小各姓連在一起刻在木板上，歃血為盟。到這時(shí)，邀請(qǐng)灣仲、占柯先侵犯歸化攻打政府軍。周于德用計(jì)謀抓獲喇嘛、灣仲，守備曹希彬又殺死占柯。丟骨、人荒、沒(méi)舌三座寨堡最頑強(qiáng)，周于德將它們都攻克了，又接連擊破卜洞王等寨堡，朱文達(dá)、郭成、邊之垣也各自攻破幾座寨堡，跟周于德的部隊(duì)匯合，于是占領(lǐng)蜈蚣、茹兒等敵軍巢穴。嘉靖初年，邊之垣的祖父邊輪當(dāng)指揮時(shí)討伐茹兒的強(qiáng)盜，被強(qiáng)盜殺害，強(qiáng)盜把邊輪的頭骨上漆當(dāng)作喝水飲酒的工具。到這時(shí)已有六十年，邊之垣才得到它，把它拿回去埋葬了。
匪徒屢次失敗，處境困難，全都拋棄輜重引誘政府軍。政府軍不上當(dāng)，殺敵入關(guān)，匪徒多戰(zhàn)死。河?xùn)|平定，不久渡河向西進(jìn)軍，接連攻克西坡、西革、歪地、乾溝、樹(shù)底各敵據(jù)點(diǎn)。有一個(gè)名叫小粟谷的，首先叛亂。偵察大部隊(duì)西行，不做防備。郭成在晚上偷襲它，大獲全勝。牛尾砦形勢(shì)尤其險(xiǎn)惡，官兵分三路夾攻，放火燒毀柵欄，殺死敵匪頭子合兒結(jié)父子，河西也平定了。各部軍隊(duì)繳獲匪徒搜集的糧食，停留了十天，將所有的寨堡都放火燒了，在六月份凱旋回師。那些逃入深山老林的，請(qǐng)求偏頭結(jié)賽投降，李應(yīng)祥命令他們埋奴發(fā)誓，然后同意了。所謂“埋奴”，是指當(dāng)?shù)赝林祷亟觼?lái)奴隸，把他們送到軍隊(duì)前面，指天發(fā)誓，立即把他們牽到大路上，挖坑埋葬，將頭留在外面，一共埋了二十三個(gè)人。偏頭結(jié)賽一向跟天竺僧人很好。僧人說(shuō)雞狗之年，土著有災(zāi)難，偏頭結(jié)賽相信他的話，預(yù)先躲到深山里去。逃亡的匪徒把他當(dāng)作神一樣，跟著他，請(qǐng)求他收容，所以偏頭結(jié)賽請(qǐng)求投降。這一仗，焚毀碉堡一千六百多座，活捉匪徒頭目三十多人，俘虜數(shù)以千計(jì)。從此之后，各土著少數(shù)民族受到極大的震動(dòng)，不敢再為非作歹，邊疆人民樹(shù)立石碑記載了這次功績(jī)。
建昌、越..各衛(wèi)所，各少數(shù)民族與漢人雜居。建昌叛匪頭目有安寧、五咱、王大咱等人，跟越..邛部黑骨夷一起發(fā)作叛亂。巡撫徐元泰準(zhǔn)備討伐，征兵一萬(wàn)八千人。仍然讓朱文達(dá)、邊之垣分別帶領(lǐng)，由李應(yīng)祥統(tǒng)帥，副使周光鎬監(jiān)督。十一月，周光鎬先渡過(guò)瀘江，黑骨夷和王大咱已經(jīng)占據(jù)相嶺，焚燒了三峽橋，五咱等人也侵犯禮州、德昌二所。這時(shí)征兵還沒(méi)有集中，周光鎬先布置疑陣，來(lái)試探相嶺的匪徒，匪徒果然退到桐槽據(jù)守。桐槽是王大咱的大本營(yíng)。不久各路兵都抵達(dá)越..。李應(yīng)祥命令朱文達(dá)攻擊五咱，邊之垣攻擊王大咱，暫且將黑骨夷放到一邊不做處理。半夜疾行軍三百里直達(dá)禮州。匪徒渡河渡到一半，朱文達(dá)打敗了他們，于是渡過(guò)河直搗敵人的老巢。邊之垣也多次攻陷桐槽，王大咱逃入山谷中。
不久，五咱占領(lǐng)磨旗山向政府軍挑戰(zhàn)。政府軍從兩邊夾擊，匪徒撤退到毛牛山設(shè)防。毛牛山延綿廣大六七百里，連接很多土著部落，朱文達(dá)部大敗毛牛山匪徒，五咱向西逃跑，跟安守匯合，在西溪構(gòu)筑防御工事。正好征集的三千鹽井馬剌兵趕到，面目猙獰，跳躍前進(jìn)，形象不同于一般人，各土著非常害怕他們。李應(yīng)祥偵探到匪徒將要來(lái)劫營(yíng)，于是悄悄地將自己的軍營(yíng)遷走，而讓馬剌兵駐扎在自己兵營(yíng)的原處。到了晚上匪徒來(lái)偷襲。馬剌兵奮起還擊，匪徒死傷遍地。各將領(lǐng)于是進(jìn)攻西溪，北面到達(dá)磨砦七板番。各路兵匯合在一起準(zhǔn)備攻打五咱，而命令副將田中科在麥達(dá)扎營(yíng)，威脅安守。正好有間諜報(bào)告安守計(jì)劃襲擊田中科，李應(yīng)祥跟材官高逢勝喝了三大杯酒，命令他率領(lǐng)三百人的敢死隊(duì)疾行軍七十里，抵達(dá)麥達(dá)設(shè)下埋伏，安守晚上到來(lái)，遇埋伏被活捉了。安守是眾匪徒的首領(lǐng)，安守死，西南邛笮、苴蘭、靡莫各土著首領(lǐng)都感到震動(dòng)害怕。商山四堡的土著向邊之垣乞求投降，大小七板番向朱文達(dá)乞求投降。各自在路旁埋奴，呼號(hào)叩頭，發(fā)誓世世代代不敢叛亂。五咱勢(shì)單力薄，逃往昌州，也被副將王言抓獲了。
土木安四兒，居住在連昌城中，偷偷地到城外搶劫騷擾，到這時(shí)得知災(zāi)禍要降臨了。率領(lǐng)黨徒幾百人逃到虛郎溝，把那里作為據(jù)點(diǎn)。各軍消滅五咱后，李應(yīng)祥把軍隊(duì)派往北邊，裝出將要討伐黑骨夷的樣子，安四兒于是放松了警惕。李應(yīng)祥忽然揮軍回頭襲擊他，抓獲了安四兒。
又討伐王大咱。當(dāng)初，王大咱失敗，躲藏到他的朋友普雄土著首領(lǐng)姑咱的住處，李應(yīng)祥大軍到來(lái)，姑咱害怕了，秘密告訴了副將王之翰，王之翰搜查到了王大咱，而黑夷的土著首領(lǐng)阿弓等七個(gè)人住在大孤山，在此之前也被王之翰抓獲了。到這時(shí)建昌、越..各土著都平定了。獻(xiàn)首級(jí)二千多兵，招降三千多人。這時(shí)是萬(wàn)歷十五年(1587)七月。
土著部落膩乃屬于邛部，鄰近馬湖。它的首領(lǐng)撒假跟他的表兄安興、木瓜部落的白祿、雷坡的強(qiáng)盜楊九乍等人，多次侵犯搶劫內(nèi)地。巡撫曾省吾準(zhǔn)備討伐他們。正好都蠻戰(zhàn)役，沒(méi)有實(shí)行。于是修建六座碉堡，增加防守兵力一千二百人，而各土著仍像過(guò)去一樣猖狂。等到建昌、越..打仗時(shí)，各土著又窩藏叛匪。徐元泰于是命令都指揮李獻(xiàn)忠等人分兵圍剿。匪徒假裝投降，誘惑抓住李獻(xiàn)忠等三位將領(lǐng)，殺死士兵數(shù)千人，勢(shì)力更加猖獗。李應(yīng)祥等人回師凱旋，徐元泰更加征發(fā)播州、酉陽(yáng)等地的土著兵，一共五萬(wàn)人，命令李應(yīng)祥統(tǒng)帥朱文達(dá)、邊之垣和周于德各將領(lǐng)分三路進(jìn)入，原總兵郭成也隨軍出征。十月，周于德首先打敗白祿兵，追到馬蝗山，攀登索梯上山，匪徒潰敗。乘勝攻擊木瓜部，射死白祿。追趕到利濟(jì)山，雪有幾尺深。周于德首先登山，再次大敗匪徒，放火焚燒了敵據(jù)點(diǎn)。當(dāng)初，撒假跟陳九乍率領(lǐng)一萬(wàn)人占據(jù)山頭，播州兵把他們打跑了。到這時(shí)，朱文達(dá)又一次在大田壩打敗他們，匯合周于德部追擊，所到之處都取得勝利。游擊萬(wàn)鏊在鼠囤偷襲撒假，抓獲了他的妻子、兒子。郭成又在三寶山跟撒假大戰(zhàn)，活捉了他。安興據(jù)守大本營(yíng)，朱文達(dá)、萬(wàn)鏊分兵進(jìn)擊，抓獲了他的母親、妻子。安興在逃跑途中丟一些金子，減緩追趕他的人的速度，于是才得以逃脫。不久，各路大軍深入進(jìn)剿，最終抓獲了他。其他土著部落害怕而投降的有二千多人。全部都交出了田地，愿意向朝廷進(jìn)貢，于是罷兵。一共斬首一千六百九十，俘虜七百三十多人，在這個(gè)地方設(shè)置屏山縣。按軍功，李應(yīng)祥累積加官到都督同知，徐元泰也做到兵部尚書(shū)。
這時(shí)，四川一帶厲害的盜匪都已平定，李應(yīng)祥威名遠(yuǎn)揚(yáng)。御史傅霈巡檢部屬，責(zé)備李應(yīng)祥冒領(lǐng)軍餉。李應(yīng)祥賄賂他八千兩銀子，被他上報(bào)了，罷了李應(yīng)祥的官。兵部推薦李應(yīng)祥做南京右府僉書(shū)，給事中薛三才堅(jiān)持不同意。
萬(wàn)歷二十八年(1600)大規(guī)模征伐播州。貴州總兵官董元鎮(zhèn)停留不前，總督李化龍彈劾他，推薦李應(yīng)祥代替他。這時(shí)軍隊(duì)分為八道，貴州分為烏江、興隆二道。下詔董元鎮(zhèn)充當(dāng)事官由烏江道進(jìn)入，李應(yīng)祥由興隆道進(jìn)入，各道限定在二月十五日進(jìn)兵。李應(yīng)祥還沒(méi)有上任，副將陳寅等人已連克數(shù)座敵營(yíng)，將匪徒趕到四牌高囤下面，另外派小分隊(duì)從小路直搗龍水囤。其他將領(lǐng)蔡兆吉又從乾坪抵達(dá)箐岡，經(jīng)過(guò)四牌。強(qiáng)盜頭子謝朝俸經(jīng)營(yíng)他的根據(jù)地，四面都是叢林峭壁，前面有二道關(guān)隘。強(qiáng)盜們從高處往下吶喊沖擊，政府軍拼死作戰(zhàn)，俘虜了謝朝俸的老婆孩子，乘勝利之勢(shì)進(jìn)抵河畔，正好碰到烏江失敗的書(shū)信到達(dá)，收拾部隊(duì)原地待命有十來(lái)天。等到李應(yīng)祥上任，便催促各將領(lǐng)快速渡河，陳寅等人于是一邊從其他途徑渡河，一邊卻偷偷地架設(shè)浮橋渡過(guò)大部隊(duì)。各軍渡河后，匪徒失去可以憑借的天險(xiǎn)，紛紛乞求投降，李應(yīng)祥全都接受了。匪徒所憑借的只有黃灘關(guān)，它像墻壁一樣陡直，眾匪徒在那里死守。正好匪徒石勝俸等率領(lǐng)一萬(wàn)多人投降，告訴說(shuō)：“離黃灘三十里有三個(gè)關(guān)隘，是進(jìn)入播州的門(mén)戶，先攻取這三關(guān)，那么黃灘就孤立難守了?！崩顟?yīng)祥同意了這個(gè)計(jì)劃，命令陳寅率領(lǐng)精兵四千人在夜晚抵達(dá)關(guān)下。石勝俸帶著幾十個(gè)騎兵引誘匪徒開(kāi)門(mén)，然后殲滅了守門(mén)匪徒。黃灘的匪徒們害怕了。陳寅統(tǒng)領(lǐng)各位將領(lǐng)渡河猛攻關(guān)前，石勝俸從墳林暗渡偷襲關(guān)后，匪徒于是大敗。李應(yīng)祥直達(dá)海龍囤，聯(lián)合各路部隊(duì)一起消滅了楊應(yīng)龍。
播州平定后，回師鎮(zhèn)守銅仁。第二年改派鎮(zhèn)守四川，播州匪徒的余黨吳洪、盧文秀等人討厭有關(guān)部門(mén)法令太嚴(yán)，而遵義知縣蕭鳴世又不得人心。吳洪等人于是宣稱楊應(yīng)龍還有兒子在世，聚集眾人叛亂。李應(yīng)祥隨同副使傅光宅一起搜捕他們，將他們?nèi)孔カ@。李應(yīng)祥不久死于任上。因?yàn)槠蕉úブ萦泄?，?zèng)左都督，世代蔭封為千戶。
李應(yīng)祥作為將領(lǐng)，有勇有謀，所到之處都捷報(bào)頻傳。平定四川三大盜匪，李應(yīng)祥居功最多。
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