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《想當廚子的生物學家是個好黑客》第11章(11)

想當廚子的生物學家是個好黑客 作者:(美)馬庫斯·烏爾森


對于人類這樣已經將遺傳圖譜繪制出來的生物來講,DNA測序儀能夠根據(jù)已知的模式,自動把這些片段拼接起來,最后形成整個基因組的序列。但是,每個物種都有自己的基因組。已知的動物有100多萬種,更不要說植物、真菌、細菌和其它單細胞生物了,所以需要進行基因組圖譜繪制工作的物種數(shù)量是無窮無盡的。到目前為止,每一種首次進行全基因組測序的物種仍舊需要依靠人類的現(xiàn)有知識和靈感去搞明白該怎么把這些片段拼在一起。

麥考利白天的工作不僅僅是給那些尚未測序的物種進行測序工作。癌細胞也有自己的遺傳特征。在麥考利與其同事把不同種類癌細胞的獨特序列拼接起來的過程中,他們也將這些數(shù)據(jù)貢獻給癌癥基因組圖譜計劃(The Cancer Genome Atlas)。該計劃是由聯(lián)邦政府資助的聯(lián)合項目,旨在深入了解遺傳因素在疾病中扮演的角色。通過對比健康組織和癌變組織的DNA,他們希望能夠提供信息給研究人員,讓他們大概知道癌癥出現(xiàn)時究竟是那些正?;虬l(fā)生了突變。

麥考利不會將自己的工作帶回家做,至少他在家里做的事情跟工作并不完全相同?;氐郊依?,他感興趣的工作會把他引到房子后面的車庫中,在那里,他正開展一個自己的研究項目,他只稱其為“獨門秘方”。對于這個項目,他并不愿意多談,因為像很多發(fā)明家一樣,他相信他的工作會產生重大發(fā)現(xiàn)。他也如同硅谷的企業(yè)家一樣,非常善于把自己的創(chuàng)意用華麗的詞匯包裝起來。

麥考利的雇主及其主要競爭者所制造的是用來閱讀DNA序列的高端器材。這些設備的購買價格和使用成本高得驚人,至少對普通消費者如此。而在低端產品中,有一種叫做微陣列芯片(microarray)的產品,其中含有量身定做的化學物質,可以與特定序列的目標DNA結合,研究人員可以將微陣列芯片用作特定短鏈DNA的探針。麥考利察覺,這兩種產品之間缺少一種中檔產品,他希望自己可以填補這一空白。

麥考利希望他能在車庫中將自己電子工程、計算機編程、生物信息學和納米技術等相關背景結合起來,創(chuàng)造一種能隨時隨地解讀DNA的電子裝置。。與微陣列芯片不同,他的裝置不需要依靠雜亂昂貴的化學物質完成這項工作。他的DNA探針將幾乎完全依靠電子技術去識別特定的DNA樣品。

“你能快捷、便宜、反復地完成對DNA的解讀”麥考利說:“我已經能設想得到你用電場、DNA和傳感裝置完成這一簡單明了的工作了?!?/p>


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