雖然看上去不大情愿，但陸軍高層仍然愿意讓陸軍航空隊獲得獨立，究其原因一方面在于陸軍擔(dān)心如果不讓飛行分隊離開的話，后者有可能喧賓奪主；另一方面則由于在地面戰(zhàn)斗中，指揮官對支援的空中掩護部隊沒有直接指揮權(quán)，陸軍預(yù)見到在指揮與控制上遲早會產(chǎn)生問題。作為回應(yīng)，自信滿滿的航空隊將領(lǐng)們認(rèn)為只要自己擁有投放“炸彈”的能力，其他軍種都將順理成章地淪為二流角色，單憑航空兵便可以迅速、輕易打贏任何一場未來戰(zhàn)爭，而海軍當(dāng)時還無力投放核武器。鑒于蘇聯(lián)毫無海軍實力可言，有些人甚至質(zhì)疑海軍在美國未來的軍事發(fā)展中是否還有必要存在。
海軍對此反唇相譏，堅持認(rèn)為控制海權(quán)對國防仍然至關(guān)重要，海軍航空兵（包括核武器）在執(zhí)行關(guān)鍵的海上任務(wù)時不可或缺。鑒于在投放原子和亞原子武器方面需要就多變的對抗局勢作出抉擇，海軍將領(lǐng)認(rèn)為陸基航空兵在這一點上不具備海軍航母艦隊一貫具有的靈活性。
正當(dāng)各軍種為各自在國家防御體系中的角色爭論不休之際，華盛頓的國會圈子也在推動事態(tài)的發(fā)展。國會議員們希望確保國家軍事力量能夠更好的協(xié)調(diào)一致，保證既擁有更高的效率，又能節(jié)約開支。1947年《國家安全法》隨之出臺。這一法案并未使各軍種達(dá)成一致，反倒成立了美國空軍，使之成為武裝部隊中一個單獨、平等的兵種。不過，新成立的空軍并未吸收隸屬海軍與海軍陸戰(zhàn)隊的航空部隊。這一法案也未廢除海軍陸戰(zhàn)隊，陸戰(zhàn)隊依然保留作為海軍的分支軍種。
1947年《國家安全法》同時成立了國家安全委員會。國家安全委員會由國務(wù)卿、國防部長（具有內(nèi)閣部長級別的新職位）、三大軍種部長（此時為次于內(nèi)閣部長級別）與總統(tǒng)任命的其他部署首腦組成，負(fù)責(zé)為總統(tǒng)出謀劃策，協(xié)調(diào)與整合一切國家安全政策。
該法案還成立了一個被稱作“國家安全機構(gòu)”的二級機構(gòu)。該機構(gòu)歸國防部長領(lǐng)導(dǎo)，由陸、海、空三軍文職部長組成，旨在統(tǒng)一指揮三大軍種。國防部長反過來將在政策方面得到參謀長聯(lián)席會議的建議。參謀長聯(lián)席會議由三軍各派一名參謀長組成，同樣負(fù)責(zé)就軍事事務(wù)為總統(tǒng)出謀劃策。這樣，三大軍種將成為行政管理部門，各軍種部長由國防部長監(jiān)督協(xié)調(diào)，各軍種首腦就政策問題向國防部長與總統(tǒng)提出建議。而國家安全委員會則保證政府各文職行政部門通力合作。
這樣的機構(gòu)設(shè)置很快暴露出一個明顯缺點：國防部長幾乎無權(quán)敦促各軍種部門協(xié)同合作。因為各軍種部長擁有龐大的參謀隊伍，并且可以通過國家安全委員會和其他非正式渠道與總統(tǒng)直接溝通。各位部長并不介意使用這些渠道，這樣一來他們只要離總統(tǒng)夠近，便可以撇開國防部長行事。
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